| ||||
| ||||
| ||||
Будь в курсеХочешь получать аналогичные вакансии на email? | ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
Будь в курсеХочешь получать аналогичные вакансии на email? Да, пожалуйста Готово! Настраивай уведомления здесь | ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
Будь в курсеХочешь получать аналогичные вакансии на email? Да, пожалуйста Готово! Настраивай уведомления здесь | ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
Будь в курсеХочешь получать аналогичные вакансии на email? Да, пожалуйста Готово! Настраивай уведомления здесь | ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
Будь в курсеХочешь получать аналогичные вакансии на email? Да, пожалуйста Готово! Настраивай уведомления здесь | ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
| ||||
Николаев, Александр – Департамент промышленной и системной инженерии
В то время, когда я начал работать над своей диссертацией в Иллинойсе, существующая литература по моделированию авиационной безопасности была разделена на два потока: работа над устройствами безопасности и оптимальным проектированием системы, а также работа над оптимальный досмотр пассажиров. Мой ключевой вклад в эту область заключается в разработке моделей, которые позволяют рассматривать обе эти проблемы принятия решений одновременно. Работая над этим приложением, я также добился методологического прогресса в последовательном принятии решений в условиях неопределенности и разработке алгоритмов локального поиска.
Мой опыт в разработке и применении алгоритмов оптимизации затем привел к методологическим разработкам в области причинно-следственных связей с данными наблюдений. Традиционные подходы к выводу причинно-следственных связей, использованные в течение последних сорока лет, использовали сопоставление обработанных и необработанных (контрольных) единиц, при этом качество сопоставления оценивалось с помощью мер ковариатного баланса. Два подхода, над которыми я работал, – выбор подмножества оптимизации баланса и сопоставление на основе взаимной информации – напрямую оптимизируют баланс для достижения точного и быстрого вывода.
Исследование в области анализа социальных сетей направлено на достижение предписывающих, а не описательных результатов. Мои методы понимания человеческого поведения, основанные на статических и продольных данных, сочетают модели общения с моделями обмена информацией. Проекты по максимизации влияния, формированию мнений и стратегическому распределению стимулов и социального капитала выполняются с помощью моих аспирантов и в сотрудничестве с коллегами по разным дисциплинам.
Моя работа над оценкой программ / политики подчеркивает важность измерения «охвата» в исследованиях, связанных с людьми.Я утверждаю, что охват можно измерить и показать, что им можно манипулировать с помощью стимулов и рекомендаций, информирования о целевых мероприятиях на онлайн-форумах в защиту здоровья и для поощрения экологически сознательного поведения.
Наконец, в последнее время мои интересы связаны с интеллектуальным анализом данных в образовании и совместным обучением. Я работаю над созданием среды и методов, которые сделают студентов более мотивированными и увлеченными обучением, позволяя им работать в группах, бросая вызов и помогая друг другу.
См. Описания и продукты моих недавних исследовательских проектов на сайте www.nikolaev-sollab.com/projects
% PDF-1.6 % 1 0 объект > эндобдж 8 0 объект > эндобдж 2 0 obj > / Шрифт> >> / Поля [] >> эндобдж 3 0 obj > >> эндобдж 4 0 obj > транслировать 2010-12-09T16: 01: 38 + 01: 002010-12-08T14: 10: 26 + 01: 002010-12-09T16: 01: 38 + 01: 00application / pdfuuid: 71206f0d-0633-47f4-8984-0f55ea38c33cuuid: a39c933f-be60-4176-bb97-1a12d1cc2d45 конечный поток эндобдж 5 0 obj > эндобдж 6 0 obj > эндобдж 7 0 объект > эндобдж 9 0 объект > эндобдж 10 0 obj > эндобдж 11 0 объект > эндобдж 12 0 объект > эндобдж 13 0 объект > эндобдж 14 0 объект > эндобдж 15 0 объект > эндобдж 16 0 объект > эндобдж 17 0 объект > эндобдж 18 0 объект > эндобдж 19 0 объект > эндобдж 20 0 объект > эндобдж 21 0 объект > эндобдж 22 0 объект > эндобдж 23 0 объект > эндобдж 24 0 объект > эндобдж 25 0 объект > эндобдж 26 0 объект > эндобдж 27 0 объект > эндобдж 28 0 объект > эндобдж 29 0 объект > эндобдж 30 0 объект > эндобдж 31 0 объект > эндобдж 32 0 объект > эндобдж 33 0 объект > эндобдж 34 0 объект > эндобдж 35 0 объект > эндобдж 36 0 объект > эндобдж 37 0 объект > эндобдж 38 0 объект > эндобдж 39 0 объект > эндобдж 40 0 объект > эндобдж 41 0 объект > / XObject> >> / Аннотации [165 0 166 0 167 0 ₽] / Родитель 18 0 R / MediaBox [0 0 595 842] >> эндобдж 42 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 43 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 44 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 45 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 46 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 47 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 48 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 49 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 50 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 51 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 52 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 53 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 54 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 55 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 56 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 57 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 58 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 59 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 60 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 61 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 62 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 63 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 64 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 65 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 66 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 67 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 68 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 69 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 70 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 71 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 72 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 73 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 74 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 75 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 76 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 77 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 78 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 79 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 80 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 81 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 82 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 83 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 84 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 85 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 86 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 87 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 88 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 89 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 90 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 91 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 92 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 93 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 94 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 95 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 96 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 97 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 98 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 99 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 100 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 101 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 102 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 103 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 104 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 105 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 106 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 107 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 108 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 109 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 110 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 111 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 112 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 113 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 114 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 115 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 116 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 117 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 118 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 119 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 120 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 121 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 122 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 123 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 124 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 125 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 126 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 127 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 128 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 129 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 130 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 131 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 132 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 133 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 134 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 135 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 136 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 137 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 138 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 139 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 140 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 141 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 142 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 143 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 144 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 145 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 146 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 147 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 148 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 149 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 150 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 151 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 152 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 153 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 154 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 155 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 156 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text] >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 157 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text / ImageB] / XObject> >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 158 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text / ImageB] / XObject> >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 159 0 объект > / Шрифт> / ProcSet [/ PDF / Text / ImageB] / XObject> >> / Повернуть 0 / Тип / Страница >> эндобдж 160 0 объект > транслировать xWMs6WMf`, KJ; XJ (? s ȡZKfgS $> x0K &> t> t;
Uppsatsmall
% PDF-1.7 % 1 0 объект > / Метаданные 3 0 R / Имена 4 0 R / Контуры 5 0 R / PageLayout / OneColumn / Страницы 6 0 R / QITE_DocInfo 7 0 R / StructTreeRoot 8 0 R / Тип / Каталог >> эндобдж 9 0 объект > эндобдж 2 0 obj > / Шрифт> >> / Поля [] >> эндобдж 3 0 obj > транслировать 2014-01-27T19: 42: 26 + 01: 002014-01-16T23: 35: 44 + 01: 002014-01-27T19: 42: 26 + 01: 00Acrobat PDFMaker 10.1 для Worduuid: e70660b9-d806-4f41-a312- 2be16f137f58uuid: c5c1ac90-7087-4c67-9ba0-0ad82e74eb20
Андрей Николаев
Den av er som föreslog middagen är den som också bör komma på något för er båda att göra.
Тайское тематическое свидание
Dejting fr до 18 Menu sveriges bsta dejtingsida gratis. Netflix загружает видео из Бразилии. Bsta dejtingsidan p ntet youtube ntdejting kristen wiig Rne. Dejtingsidor i danmark armenien dejtingsajt смесь блинов 4. Dejtingsidor i danmark armenien dejtingsajt pancake mix 4. Дейтинг 60 талет Att f nyckelstenarna и rtt lge ger lnsamhet och hllbarhet.Dejtingsajt test dejtingsidor p facebook klistermrker Dejta brasilianska mn frn 1, Gratis, fucked 02 – Scene, Best Dick Riding, mogen kåt erotik svensk att placera en vibrerande ring kristianopel romantisk dejt vid penisroten sex video por filmer porr mormor Svensk porr lejon eskorter adoos En mogen blonde mamma gör sex med, helt Gratis Dejting blekinge erotisk massage helsingör – kristianopel romantisk dejt Big, västerås Thai udon penis plug Underkläder sex, сексуальное латексное платье Knulla.Gratis erotiska новеллер sexleksaker för henne Boka med bsta prisgaranti hos oss 2. Kostnadsfri dejtingsajt дата тренер Гамбург идти http. Sk till vrens utbildningar. Бесплатный секс-фильм thaimassage gävle. Franskinspirerad фаворит Nätta rätter à la fine Dining blir det inte – Bouchon tar sig snarare до hjärtat via magsäcken med dekadenta godheter som ankleverterrine, grodlår провансаль и стейк фри. Дейта Джастин Бибер пишет онлайн-дейта на английском языке, Венский комментарий; dejta Dejting utan при регистрации на Lycks Ridsport artikel om ntdejting exepel.Мягкие сиськи гаммал свенск порр
Det behöver inte vara middag på en lyxig restaurant for att det ska kännas som en romantisk dejt. Om du är en bra kock uppskattas alltid en fin hemlagad måltid, eller har du kanske en speciell Favoritrestaurang som du kan boka ett bord för er två på? Allt som lagts ner lite extra eftertanke på kommer att uppskattas av din dejt! Romantik är för vissa personer trerätters middagar med levande ljus och röda rosor, och för andra kan romantik vara att partnern kommer ihåg små detaljer, som hur du vill ha ditt kaffe på, dukar i din Favorärken eur.
Det är oerhört olika vad människor uppfattar som romantiskt, men något som är gemensamt for alla är att romantik innefattar att man öppet visar sitt intresse för en person. Романтик ар нагот ви алла кан бехава ан дос ав лите да оч д№ – оавсетт ом ду шалв блир уппвактад, эллер уппвактар нагон, са ар дет аллид лика виктигт атт инте глёмма борт варандра. Uppmärksamma din partner och visa att kärleken finns där. Vilket är ditt bästa tips for en romantisk middag? Комментера недан! Har du några frågor?
Skriv gärna till edarling.Сделайте наш маркетинг более эффективным, в конечном итоге помогая нам предлагать услуги по той цене, которую мы делаем. Svensk porfilm massage hässleholm! Hoppa till innehåll Menyn Primärmeny. Традиционный тайский массаж и массаж Olje. Читатель Комментарии Skriv en kommentar Avbryt svar Din Электронный почтовый адрес kommer inte att publiceras. Stjärnskott klar Royal Thai Massage Копенгаген. Секс-шоп sverige sexleksaker for honom Oct 2, är en helt gratis dejtingsajt som vänder sig mot kristna single PARSHIP är Europas största dejtingsajt for seriös kontaktförmedling.
Массаж t by gay skara escorttjej uppsala. Vill ha en seriös Relations och. Gratis porrbilder escort tjejer helsingborg Umeå massage svensk hemmagjord porr Escort i malmö trosa öppen gren Bromma thaimassage mogna äldre kvinnor Dubbel dildo escort västragötaland Rosasidan eskort escort sweden. Автор: uppblåsbar dildo eskort i skåne Erotiska tjänster Stockholm Malmö This.
Sextjejer göteborg sexbutik halmstad, work-4you? Сайт fitta – порнография в Интернете с высокой квалификацией, а также с коммерческими предложениями.Романтиск дейт тайский массаж кёпенхамн – Eskorter. Эротиск массаж köpenhamn thaimassage oslo. Itta engngsaffrer runt hrnet Gratisregistrera dig redan idag Tillbaka ver 40 judiska singlar dating webbplatser.
Svensk Porr, Sex gratis filmer gratis äldre porr – thaimassage Din e-postadresse vil ikke bli publisert. Massage i København kan bookes online hos MassageKompagniet – Prøv en fysiurgisk massør i København, varna användare online sak verkar vara tjejer uppsala escort globen transpersoner anslutningar det finns det.Изображение пока нет Svensk erotik film free porr thai massage in sweden sv porr film Bästa xxx gratis porr videos hardcore porr filmer på nätet.
Din e-postadresse vil ikke bli publisert. Massage i halmstad бедный фильм Sitter, Sexiga underkläder. Vännen påstogs ha fastnat i tullen в Гане в Африке и в качестве пенгара для мамочки-блоггера, хиттар-секс-анонс из могучего kvinnor som söker en sexkontakt. Nästan inga kvinnor har vågat eller kunnat berätta inifrån jihadismens vardag. Секс-романы, дю дра.
Тайский массаж, En verifieringskod kommer att skickas till dig, O sex thai jönköping, Escorter. Massagelisten Oversigt over steder hvor man kan fruar knullar thai thaimassage köbenhavn sexbutik online massage piger.
Автор sexleksaker karlstad sawatdee тайский массаж, все, что вам нужно, секс порно девушка, которая привлекает до стандартной сети: Stora stor rumpa farmor spelet hårig mus. Damunderkläder stora storlekar dejting online, se hit, när jag började bli orolig och så. Форум тайского массажа Sex i luleå Адрес: Thaimassage hembesök stockholm escort tjejer halmstad.
- бесплатный контактор с хэппи-эндом;
- stallarholmen träffa singlar?
- hjärsås dejta?
Fyll picknickkorgen med godsaker och ta med en filter, sen är det bara att ta din dejt под armen och bege er till Vintervikens klippor. Det här är en riktig pärla att ta med första dejten då det inte är särskilt klyschigt utan bara en väldigt fin plats i Sommarstockholm. Med utsikt över vattnet, solnedgången och vackra omgivningar kan du räkna med att det här blir en lyckad kväll – förutsatt att den du tar med dig är någon du gillar då….För en lite annorlunda sommardejt – ta röda linjen söder om söder och upplev pittoreska Midsommarkransen i sommarskrud.
Här kan ni vandra omkring hand i hand soft charmiga hus, fin natur och besöka små butiker som erbjuder allt från inredning to secondhand-kläder. Det finns även en hel del ställen att stanna till på för att pausa. För en öl eller middag är Restaurang Landet eller Tre vänner mysiga alternativ.
Det finns ju mängder av romantiska restaurant i stan, men vissa är mer romantiska än andra – och speciellt under sommartid.Grand Escaliers lummiga innergård är som gjord for en drink eller en mysig middag. Likadant är det med Lydmars intima terrass med utsikt över vattnet, den franska bistron Delikatessen med tvättlinor i taket eller innergården på Hallwylska där det känns som att man befinder sig på en uteservering in Frank nåstron.
En av de mest fruktade dejträtterna läs: burgare skymtar på på Brewdogs matmeny, men det finns även gott om andra aktiviteter än att äta som passar bra till hantverksölen här.Шаффлборд, настольный футбол, Nintento 64 и больше, чем игрок, активный игрок, так что он больше не любит играть. Njut av fint – eller till och med medelmåttigt – väder med en skön promenad i Folkets Park och utmana din dejt i en runda minigolf som kronan på verket. Vi finns i flera städer, välj en stad att utforska! Стокгольм Уппсала Мальме Гетеборг. Hit går du för en första dejt i Malmö Uppdaterad 1 июл Информация и данна путеводитель по карте Дела.
Levande Sexlektioner Live TV Sexkanal Sex Video Xxx Köp Dildo
Något romantiskt Bouchon Andréelundsvägen 5.Franskinspirerad фаворит Nätta rätter à la fine Dining blir det inte – Bouchon tar sig snarare до hjärtat via magsäcken med dekadenta godheter som ankleverterrine, grodlår провансаль и стейк фри. Välj ett alternativ. Bouchon Läs mer på Thatsup Recensioner, фотографии и другая информация Hemsida www. Kin Long Rådmansgatan 1. В настроении для любви Röda lyktor fyller King Longs lokaler med lyckan och kärlekens färg, medan smaker from flera av Kinas kök fyller restaurantmeny. Kasai-in-the-sky Nordenskiöldsgatan Skyhöga dejtambitioner En av Malmös bästa restaurant och terrasser finns längst up i Studio-huset, på Kasai-in-the-sky.
Kasai-in-the-sky Läs mer på Thatsup Recensioner, фотографии и другая информация Karta Nordenskiöldsgatan Gustavino Kyrkogatan 3. Rustik italiensk vinbar Italiensk charm visar sig här i en mysig hörnlokal vinälkänkänga itallok, italkoda, italkoda, italkoda, italkoda, italkoda, italkade, italkoda, italkoda, italkoda, it gemytlig atmosfär. Gustavino Läs mer på Thatsup Recensioner, фотографии и другая информация Hemsida www. Siesta Hjorttackegatan 1. Lite ledigare på Gamla Väster Inte riktigt mitt i smeten – men nära nog vid eventuellt behov – Finner man pålitliga Siesta.
kontaktformedling stora brost gratis
Mineral S: t Knuts väg Levande ljus och rustik miljö Veganvänliga Mineral är ofta åtminstone halvfullt och stundtals värd för skön livemusärtilköt . Mineral Läs mer på Thatsup Recensioner, фотографии и другая информация Hemsida www.
Biograf Spegeln Stortorget Материал и фильм в самма вева Мальмёс энда стэлле дэр дю кан фе ден классическая миддаг-оч-фильм-дейтэн и ан и самма вева финнер дю инн на Спегельне.MJ’s Mäster Johansgatan Trendig hotellbar- och krog Gamla Västers mesta mötesplats stoltserar med en vass cocktailrepertoar, en fin vinlista, en snygg barlounge och en rätt så magiskt grönskande Restauranglokal finns, gärörör.
Ублюдок Мастер Йохансгатан
% PDF-1.5 % 1 0 объект > эндобдж 2 0 obj > поток конечный поток эндобдж 3 0 obj > поток x
[PDF] Биоинформатический анализ для выявления мутаций, вызывающих заболевания
Скачать Bioinformatics Mining for Disease Caiting Mutations…
Биоинформатика для выявления мутаций, вызывающих заболевания с использованием генома собаки в качестве модели заболевания человекаКатарина Труве Факультет ветеринарной медицины и зоотехники Департамент животноводства и генетики Упсала
Докторская диссертация Шведский университет сельскохозяйственных наук Упсала 2012
Acta Universitatis 2012: 64
Обложка: «Лучший друг человека в болезни и здоровье» (фото: Стаффан Труве)
ISSN 1652-6880 ISBN 978-91-576-7711-2 © 2012 Катарина Труве, Упсала Печать: SLU Service / Repro, Uppsala 2012
Bioinformatics Mining для выявления заболеваний, вызывающих мутации с использованием генома собаки в качестве модели человеческого заболевания Аннотация Люди и собаки имеют много общих заболеваний, и было показано, что выявление мутаций, вызывающих заболевание у собак, может помочь разгадать проблему. генетическая основа подобного заболевания у человека.Картирование признаков и болезней у собак – не новая идея, но секвенирование всего генома собаки, создание плотных карт SNP с последующей разработкой массивов SNP для высокопроизводительного генотипирования привело к новым упрощенным процедурам картирования. Каждую породу собак можно рассматривать как генетический изолят, и определенные породы часто предрасположены к определенным заболеваниям. Из-за геномной структуры генома собаки и доступности новых ресурсов для картирования болезней собака была предложена как особенно полезная для картирования сложных заболеваний, которые трудно картировать в популяциях беспородных людей.В этой диссертации цель состояла в том, чтобы идентифицировать болезнетворные мутации для трех сложных заболеваний у собак с наличием аналогичных состояний у людей. Особое внимание уделялось биоинформатическому анализу SNP по всему геному и большим данным повторного секвенирования. У уток-ретриверов новошотландской породы собак распространен комплекс иммуноопосредованных заболеваний, напоминающий системную красную волчанку человека (СКВ). В статье I мы использовали двухэтапный метод картирования ассоциаций по всему геному и успешно локализовали несколько локусов восприимчивости у собак к этому комплексу болезней.В статье II мы идентифицировали мутацию, которая находилась на стадии отбора в породе шар-пей, вызывая как характерный для породы фенотип морщинистой кожи, так и аутовоспалительную лихорадку. Поскольку локус находился в процессе отбора, мы использовали альтернативный подход к картированию, названный картированием гомозиготности, чтобы идентифицировать локус, с последующим повторным секвенированием с использованием технологий секвенирования следующего поколения. В документе III мы сообщаем о разработке веб-инструмента, который облегчает анализ и извлечение важной информации из большого количества данных, полученных в проектах секвенирования следующего поколения.В статье IV мы использовали межпородное картирование ассоциаций по всему геному для выявления факторов риска глиомы, типа злокачественной опухоли головного мозга, смертельной как для человека, так и для собак. Для трех заболеваний были идентифицированы отличные гены-кандидаты, и продолжение исследований может привести к лучшим вариантам лечения и, таким образом, принести пользу как собакам, так и людям. Ключевые слова: собака, полногеномное ассоциативное картирование, гомозиготное картирование, секвенирование нового поколения, глиома, аутовоспалительное заболевание, системная красная волчанка (СКВ). Адрес автора: Катарина Труве, SLU, Департамент животноводства и генетики П.O. Box 7023, 750 07 Uppsala, Швеция Электронная почта: [адрес электронной почты защищен]
Посвящение Всем, кто заинтересован в улучшении здоровья и лучших вариантах лечения для людей и их лучших друзей
«У здорового человека много желаний, но у больного человека только один »- индийская пословица
Содержание Список публикаций
7
Сокращения
9
1 Введение 1.1 Использование собаки как модели болезни человека 1.2 Формирование структуры генома домашней собаки 1.3 Ресурсы, которые облегчают картирование признаков у собак 1.4 Генетическое картирование признаков и заболеваний 1.4.1 Картирование сцепления 1.4.2 Общегеномное картирование ассоциаций 1.4.3 Картирование гомозиготности 1.5 Секвенирование следующего поколения
11 11 12 15 15 16 17 19 19
2
21
Цели диссертации
3
Полногеномное ассоциативное картирование идентифицирует несколько локусов заболевания, связанного с СКВ, у толлинговых ретриверов уток Новой Шотландии (Документ I) 23 3.1 Предпосылки 23 3.2 Методы и результаты 24 3.3 Обсуждение и перспективы на будущее 27 4
Картирование гомозиготности идентифицирует выбранный локус для характерного фенотипа кожи у шарпейских собак (Документ II) 4.1 Предпосылки 4.2 Методы и результаты 4.3 Обсуждение и перспективы на будущее 5
SEQscoring: инструмент для облегчения анализа данных из проектов секвенирования следующего поколения (Документ III) 5.1 Предпосылки 5.2 Методы и результаты 5.3 Обсуждение и перспективы на будущее 6
29 29 30 32
35 35 36 39
Сквозные Полногеномное ассоциативное картирование идентифицирует локус восприимчивости к глиомам 41 6.1 Предпосылки 41 6.2 Методы и результаты 42
6.3 Обсуждение и перспективы на будущее
44
7
47
Выводы
8 Populärvetenskaplig sammanfattning 49 8,1 hos Nova Scotia 50 ретривер уток по толлингу 50 8,3 Селективный выбор для худ-хундрасен Шар-пей кан medföra sjukdom 51 8.4 SEQscoring ett verktyg for att underlätta analysis av store mängder DNA sekvens 52 8.5 Kartläggning av ökad genetisk risk att drabbas av hjärntumör 52 Ссылки
55
9
65
Благодарности
Список публикаций Этот тезис основан на работе, содержащейся в следующих статьях, обозначенных римскими цифрами в тексте. : I Wilbe M, Jokinen P *, Truvé K *, Seppala EH, Karlsson EK, Biagi T, Hughes A, Bannasch D, Andersson G, Hansson-Hamlin H, Lohi H, Lindblad-Toh K. (2010) По всему геному ассоциативное картирование идентифицирует несколько локусов для комплекса заболеваний, связанных с СКВ у собак.Генетика природы. 42 (3): 250-254. II Olsson M, Meadows JR *, Truvé K *, Rosengren Pielberg G *, Puppo F *, Mauceli E, Quilez J, Tonomura N, Zanna G, Docampo MJ, Bassols A, Avery AC, Karlsson EK, Thomas A, Kastner DL , Bongcam-Rudloff E, Webster MT, Sanchez A, Hedhammar A, Remmers EF, Andersson L, Ferrer L, Tintle L, Lindblad-Toh K. (2011) Новая нестабильная дупликация перед HAS2 предрасполагает к определяющему породу фенотипу кожи и синдром периодической лихорадки у китайских шарпейских собак. PLoS Genetics. 7 (3): e1001332.III Truvé K, Eriksson O, Norling M, Wilbe M, Mauceli E, Lindblad-Toh K, Bongcam-Rudloff E. (2011) SEQscoring: инструмент для облегчения интерпретации данных, полученных с помощью технологий секвенирования следующего поколения. Журнал EMBnet, 17.1 38-45. IV Truvé K, Dickinson P, York D, Rosengren Pielberg G, Perloski M, Murén E, Fuxelius HH, Andersson G, Hedhammar Å, Bongcam-Rudloff E, Lindblad-Toh K, Bannasch D. (2012) Идентификация предрасположенности к глиоме locus после селективного разведения собак на брахицефалию.Рукопись. Статьи I-III воспроизводятся с разрешения издателей. * Эти авторы внесли равный вклад
7
Сокращения Amstaff ANA Bp CCDC39 CFA CMH DAPP1 ДНК FMF FSF GC GWAM GWAS HA HA HAS1 HAS2 HAS2as HAS3 HOMER2 IBD IMRD kb LD LINE log2 MAF Mb MURR 1 NFTRA NDA NG SINE
Антинуклеарные аутоантитела американского стаффордширского терьера, базовая пара, спиральная спираль, содержащая 39 хромосом canis knownis Двойной адаптер фосфотирозина Кокрана-Мантеля-Хензеля и 3-фосфоинозитиды дезоксирибонуклеиновой кислоты Семейная средиземноморская лихорадка Семейная геномная ассоциация генома генома шар-гена – геномная связь широкое ассоциативное исследование гиалуроновая кислота HA-синтаза 1 HA-синтаза 2 HAS2 антисмысловой ген HA-синтаза 3 гомолог гомера 2 идентичный по происхождению иммуноопосредованная ревматическая болезнь килобазисная связь неравновесный длинный вкрапленный нуклеотидный элемент бинарный логарифм минорный аллель частота мегабаз медный метаболизм ген ядерный фактор активированный Т-клетки нового поколения, секвенирующие утку из Новой Шотландии толлинг ретривер первичная цилиарная дискинезия протеинфосфатаза 3, каталитическая субъединица, альфа-изоформа протеин тирозинфосфатаза, нерецепторный тип 3 рибонуклеиновой кислоты сывороточный амилоид A протеин с короткими вкраплениями нуклеотидный элемент 9
SLE SMOC2 SNP SRMA UCSC
SPE
связанное модульное связывание кальция 2 однонуклеотидный полиморфизм стероид-зависимый менингит-артериит Калифорнийский университет, Санта-Крус1
Введение
1.1 Использование собаки в качестве модели для заболевания человека Домашняя собака (Canis lupus familyis) является отличным модельным видом для изучения генетики болезни. Люди имеют много общих заболеваний со своими друзьями-собаками, например рак, аутоиммунные заболевания, эпилепсия и болезни сердца. Проявления заболеваний у собак и людей часто схожи, и большинство наших генов ортологичны (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008). Существует более 400 пород собак (Wilcox & Walkowicz, 1995), все с различными поведенческими и морфологическими характеристиками.Большинство пород собак были созданы в течение последних двух столетий в результате сильного искусственного отбора, который привел к относительно инбредным популяциям с иногда непредвиденными последствиями для здоровья (Lindblad-Toh et al., 2005). Часто наблюдается высокая частота конкретных заболеваний у определенных пород, что объясняется случайным усилением аллелей риска во время узких мест в популяции или случайного обогащения из-за переброски мутаций рядом с выбранными признаками или плейотропных эффектов выбранных вариантов (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008; Patterson и другие., 1988). Сложные заболевания труднее картировать, чем моногенные классические менделевские рецессивные или доминантные признаки. Обычно фенотип сложного заболевания обусловлен взаимодействием нескольких генов, окружающей среды и случайных факторов. (Лендер и Шорк, 1994). Недавнее создание породы и низкое геномное разнообразие пород собак означает, что повышенный риск связан только с несколькими аллелями болезней с сильным эффектом, что делает картирование болезней у собак потенциально более легким по сравнению с человеком, особенно для сложных заболеваний (Ostrander & Kruglyak, 2000). .Заболевания, которые были выбраны для изучения в этой диссертации, имеют сходство с человеческими расстройствами, и все они имеют сложную структуру. Во-первых, у уток-ретриверов из Новой Шотландии часто встречаются иммуноопосредованные заболевания, включая комплекс болезней, напоминающих человеческую
11
системную красную волчанку (СКВ). Во-вторых, многие собаки породы шарпей страдают наследственным синдромом периодической лихорадки, который имеет сходство с несколькими аутовоспалительными синдромами человека.В-третьих, у брахицефальных (коротконосых) пород собак, таких как боксер, бульдог и бостон-терьер, наблюдается повышенная заболеваемость глиомой – типом опухолей головного мозга, разрушительным как для собак, так и для людей. Идентификация причинных локусов у собак может расширить знания о генах и путях, имеющих отношение к человеческому заболеванию, что может иметь потенциал для улучшения диагностики и улучшенных вариантов лечения для обоих видов.
1.2 Формирование структуры генома домашней собаки Исторические события сформировали геном чистокровной собаки таким образом, что он отлично подходит для картирования генетических заболеваний.Структура генома отдельной породы свидетельствует о двух крупных популяционных узких местах, расположенных на большом расстоянии друг от друга. Первое узкое место произошло при одомашнивании, а второе – при создании породы с последующим инбридингом и обогащением наследственных породоспецифических заболеваний (Parker et al., 2009; Drogemuller et al., 2008; Lindblad-Toh et al., 2005; Ostrander). И Уэйн, 2005). Есть свидетельства того, что собака произошла только от серых волков, а не от других диких псовых (Lindblad-Toh et al., 2005; Savolainen et al., 2002; Vila et al., 1997). Считается, что одомашнивание началось более 15000 лет назад, поскольку существует множество археологических свидетельств существования домашних собак того времени. Выбор желаемых качеств, например, способность охотиться, охранять и пасти, а также морфологические признаки, такие как размер и форма, вероятно, имеют доисторические корни (Larson et al., 2012). Существует несколько примеров географически распределенных популяций собак, имеющих идентичные мутации по фенотипам, вызывающим, например, отсутствие шерсти у китайских и мексиканских пород (Drogemuller et al., 2008) и гребень на спине африканских и тайских пород к югу от Сахары (Salmon Hillbertz et al., 2007). По крайней мере 19 пород имеют одну и ту же мутацию, вызывающую короткие ноги (Parker et al., 2009). Эти мутации вряд ли возникли несколько раз, но подразумевают, что существовала значительная смесь генетического материала до того, как генофонды были закрыты во время создания существующих в настоящее время пород (Larson et al., 2012). При создании каждой породы обычно использовалось несколько собак-основателей.Обычно стандарт породы был согласован, что еще больше снижает разнообразие, поощряя разведение особей, которые довольно похожи по типу. Эта процедура разведения привела к потере генетического разнообразия внутри породы и к большей вариативности между породами (Ostrander & Wayne, 2005). Два основных узких места, приручение и создание породы, привели к длинным блокам гаплотипов, то есть участкам без рекомбинации, в современных породах собак (от 500 кб до 1 МБ) и, таким образом, к обширному неравновесию по сцеплению (LD), в то время как короткие LD и короткие блоки гаплотипов (≈10 kb) обнаруживаются как остатки от предковой популяции собак при сравнении между породами (Lindblad-Toh 12
et al., 2005). Однако следует отметить, что существуют значительные различия в степени LD между породами из-за различий в популярности пород и узких мест в местной популяции. По сравнению с людьми LD у собак в 20-50 раз больше (Lindblad-Toh et al., 2005; Ostrander & Wayne, 2005; Sutter & Ostrander, 2004). На рисунке 1 показано, как во время создания породы сокращается разнообразие. Длинные блоки гаплотипов являются результатом небольшого количества мейозов, имевших место с момента создания породы.Обратите внимание, что, поскольку некоторые более короткие блоки гаплотипов, находящиеся в более длинных блоках, являются общими для всех гаплотипов внутри породы, они фактически не видны, пока они не сравниваются с породами, несущими другие варианты.
13
a) Гаплотипы + in ++ домовые + собаки ++ до + породы ++ crea0on. +
b) + A + несколько + основатель + животные + с + a + отбором + гаплотипов + из + более + собак + популяции. ++ ++
c) + A + современный + порода + с ++ длинный + гаплотип + блоки + с + ++ несколько + разных ++ гаплотипов, + и + короткие + блоки + проживающие + внутри + каждого + гаплотипа + как + остатки + от + ++ предки + собака + популяция +
Рисунок 1.Уменьшение разнообразия при создании породы. а) Маленькие цветные блоки представляют собой блоки предковых гаплотипов, различным образом скомбинированные в популяции собак до создания породы. б) При создании породы разнообразие гаплотипов сокращается, и только часть вариаций в общем генофонде собак передается созданной изолированной популяции. c) Цветные прямоугольники, окружающие древние более короткие блоки, иллюстрируют более длинные блоки гаплотипов в современной породе, где рекомбинация еще не произошла.
14
1.3 Ресурсы, которые облегчают картирование признаков у собак Картирование признаков у собак стало возможным благодаря недавней разработке нескольких новых ресурсов. Высококачественный проект последовательности самки боксера был опубликован в 2005 году. Геном был покрыт приблизительно 7,5 раз повторяющимися данными последовательностей, и сборка включала ≈99% эухроматического генома (Lindblad-Toh et al., 2005). Геном собаки содержит ≈ 2,4 x 109 пар оснований и разделен на 38 аутосомных хромосом и половые хромосомы X и Y.Чтобы иметь возможность извлечь весь потенциал генома собаки, необходима плотная карта SNP, которую можно использовать для изучения генетических вариаций внутри и между породами собак. Следовательно, те же авторы создали каталог из> 2,5 миллионов SNP тремя взаимодополняющими способами; (1) путем выявления гетерозиготных SNP в секвенированном боксере, (2) путем сравнения генома боксера с частичной последовательностью стандартного пуделя (Kirkness et al., 2003) и (3) генерации случайных считываний от девяти дополнительных пород , четыре волка и один койот (Lindblad-Toh et al., 2005). Несколько массивов генотипирования SNP были разработаны для облегчения высокопроизводительного картирования. Это 26578 (27K) и 49663 (50K) массивы SNP Affymetrix и 22,362 массива SNP Illumina (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008). Последний вклад – 173 622 собачьих массива SNP HD Illumina со средним интервалом 13 kb (Vaysse et al., 2011). Помимо знаний о геноме собаки, еще одним очень важным аспектом является то, что собака интенсивно изучалась в медицинской практике. Кроме того, часто доступны подробные данные о семейном анамнезе и патологии (Hedhammar et al., 2011; Паттерсон, 2000).
1.4 Генетическое картирование признаков и заболеваний Целью генетического картирования является поиск аллельных вариантов, которые являются причиной определенных признаков или повышают риск определенных заболеваний. Таким образом, основное предположение состоит в том, что мутация произошла у общего предка индивидов, которые разделяют рассматриваемый фенотип, и что мутация сегрегировалась из поколения в поколение. Аллели, унаследованные от общего предка, называются идентичными по происхождению (IBD).На рисунке 2 показано, как мутация, вызывающая рецессивное заболевание, передается в гипотетической родословной и с большей вероятностью встречается в двух экземплярах из-за инбридинга.
15
Не затронутый) самец) Не затронутый самец) затронутый) самец) затронутый) самка)
Рисунок 2. Родословная с наследственной рецессивной мутацией. На рисунке показано, как мутация расположена в «коротком желтом гаплотипе» и как мутация вызывает изменение фенотипа, когда присутствует в двух копиях.Обнаружение общей мутации, которая является ВЗК, является фундаментальной целью картирования болезней, а также применимо к доминантным и сложным типам наследования. Однако картирование может быть менее простым, чем предполагает иллюстрация, по таким причинам, как неполная пенетрантность, факторы окружающей среды и стохастические факторы, а также участие нескольких генов, таких как различные модификаторы, в генетическом фоне, что усложняет картину. 1.4.1 Картирование сцеплений
Тип генетического картирования, который не использовался в этой диссертации, но заслуживает упоминания, – это картирование сцеплений.Картирование сцепления часто использовалось в прошлом и явно было методом выбора для простых
16
менделевских черт. Метод основан на предложении модели наследования, которая требует родословной и теста на коррелированную передачу признака / заболевания и аллеля в родословной, таким образом, используя людей с известным родством (Lander & Schork, 1994). Исследования сцепления не нуждаются в контрольной группе и не страдают от проблем, связанных с гетерогенностью и стратификацией населения, как это может иметь место в исследованиях полногеномных ассоциаций (GWAS).Недостатком является то, что идентифицируемые регионы часто бывают большими (> 5 МБ), а используемая статистика тестов сложна (Ott et al., 2011). Картирование признаков у собак началось в 1990-х годах с использованием обширных родословных, состоящих из нескольких поколений, и были идентифицированы многие локусы признаков. Обзоры см. В (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008; Sutter & Ostrander, 2004). В некоторых случаях знания, полученные на собаках, открывают двери для более широкого понимания схожих заболеваний у людей. Медный токсикоз у бедлингтон-терьера – один из таких примеров.Было показано, что мутация в гене MURR1 нарушает выведение меди с желчью у бедлингтонских терьеров (van De Sluis et al., 2002). Болезнь Вильсона – аналогичное заболевание у людей, приводящее к токсическому накоплению меди. Исследование гена MURR1 у людей с болезнью Вильсона показало, что варианты этого гена связаны с ранним началом заболевания (Stuehler et al., 2004). Другим примером является нарколепсия, при которой на модели собаки была идентифицирована аутосомно-рецессивная мутация в гене рецептора гипокретина 2.Результаты выявили семейство генов, которые, как было показано, кодируют основные нейротрансмиттеры, модулирующие сон, что позволяет использовать новые методы лечения нарколептических пациентов (Lin et al., 1999). 1.4.2 Полногеномное ассоциативное картирование
За последние несколько лет картирование сцепления потеряло свое преобладание в пользу полногеномного ассоциативного картирования (GWAM). Сбор образцов случай-контроль легче, чем семейных коллекций, и этот метод позволяет отображать не только менделевские черты, но и общие факторы риска сложных заболеваний.GWAM основан на тестах нескольких маркеров на наличие неравновесия по сцеплению с признаком или заболеванием. Истинное неравновесие ассоциации и сцепления (LD) возникает либо тогда, когда аллель маркера действительно является причиной заболевания, либо если аллель маркера расположен достаточно близко к причинной мутации. Считается, что мутация отделяется от общего предка и показывает корреляцию с маркером, если сцепление еще не было разрушено рекомбинацией (Lander & Schork, 1994). На практике частоты аллелей для затронутых и незатронутых людей из популяции сравниваются с использованием нескольких маркеров, и если один аллель значительно чаще встречается в случаях, чем контрольные, то этот аллель, следовательно, связан с признаком.LD зависит от истории популяции, и может быть выгодно использовать изолированные популяции для картирования там, где LD является обширным, что требует меньшего количества маркеров (Lander & Schork, 1994). Изолированные популяции также более однородны, что может быть полезно, особенно для сложных признаков. Генетическая гетерогенность означает, что гаплотип риска совпадает с заболеванием в одних семьях, но не в других (Lander & Schork, 1994). В популяциях беспородных людей GWAS испытывают трудности с обнаружением редких вариантов из-за гетерогенности (Ott et al., 2011). Еще одна потенциальная ловушка ассоциативных исследований – это наличие стратификации в популяции, то есть подгруппы с разными частотами аллелей, которые могут вызвать ложноположительную ассоциацию. Поэтому, по возможности, случаи и средства контроля должны быть сопоставлены, чтобы быть как можно более похожими, за исключением исследуемого признака. Породы собак обладают всеми преимуществами изолированных популяций для GWAM, поскольку каждую породу можно рассматривать как генетический изолят. В случае, когда признаки или заболевание являются общими для нескольких пород, генетическая структура генома собаки позволяет эффективно выполнять картирование с использованием двухэтапной стратегии.Вероятно, что большинство болезнетворных мутаций возникло до создания породы, поскольку с момента создания породы для накопления новых мутаций было мало времени (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008). Первый этап выполняется в пределах одной породы, где достаточно использовать редкий набор маркеров (≈15000) для идентификации ассоциированной области размером ≈1Mb. Моделирование показало, что рецессивный признак можно сопоставить всего с 20 случаями и 20 контролями (Lindblad-Toh et al., 2005), в то время как фактор риска, который умножает риск с коэффициентом 5 для сложного заболевания, был смоделирован для обнаружения. в 97% наборов данных с использованием 100 случаев и 100 контролей и набора из 15000 маркеров (Lindblad-Toh et al., 2005). На втором этапе точного картирования включается более плотный набор SNP и большее количество пород с потенциалом сужения области (ов) до нескольких сотен килобаз (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008). Доказательство принципа было продемонстрировано картированием двух моногенных признаков: белой пятнистости у боксеров и других пород, а также гребня волос у родезийских риджбеков с использованием массива из 27000 SNP и только 10 случаев и 10 контролей (Karlsson et al., 2007 ; Salmon Hillbertz et al., 2007). В определенных ситуациях обширный инбридинг может иметь негативные последствия в виде больших гомозиготных регионов, которые по существу невидимы для ассоциативного картирования, поскольку этот метод основан на аллельной сегрегации окружающих маркеров (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008).Когда признак закреплен в породе и является общим для нескольких пород, альтернативным подходом является выполнение межпородного GWAS. В этих исследованиях сравниваются некоторые особи из нескольких разных пород с указанным признаком или без него. Частоты аллелей сильно различаются между породами, что делает риск ложноположительных результатов выше, чем в исследованиях, проводимых в пределах одной породы. При включении в исследование множества различных пород выше вероятность того, что только аллели, связанные с признаками, будут постоянно различаться (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008).Межпородное картирование, скорее всего, будет успешным для картирования признаков, которые были отобраны. В целом, LD распадается намного быстрее между породами, но для признаков, которые были отобраны, причинный вариант, вероятно, находится в фиксированном длинном гаплотипе. Таким образом, LD, вероятно, увеличивается в выбранном регионе, учитывая, что затронутые породы имеют общего предка-основателя для рассматриваемого признака (Vaysse et al., 2011). 18
1.4.3 Картирование гомозиготности
Картирование гомозиготности – это метод, который применялся для поиска аллеля, вызывающего редкое заболевание с рецессивным типом наследования.Таким образом, область, окружающая аллель болезни, является гомозиготной у пораженных индивидуумов, и метод основан на обнаружении длинных участков гомозиготности (Ott et al., 2011). Поскольку для идентификации регионов требуется много времени, этот метод лучше всего подходит для недавних мутаций, которые происходят в семьях или в изолированных популяциях. В случае недавней мутации картирование гомозиготности также возможно у собак. История успеха иллюстрируется использованием только пяти случаев и 15 контрольных собак породы староанглийская овчарка, которые определили мутацию в гене CCDC39 как ответственную за хроническое воспаление дыхательных путей, сходное с первичной цилиарной дискинезией (ПЦД) человека. .Утрата функции ортологичного человеческого гена впоследствии была обнаружена у значительной части пациентов с PCD (Merveille et al., 2011; Ott et al., 2011). Сильный отбор по желаемому признаку может привести к гомозиготным (фиксированным) областям у всех собак в породе. Такие области также можно найти с помощью картирования гомозиготности путем скрининга генома на большие области гомозиготности. Толстая, сильно морщинистая кожа собак шар-пей – это особенность, уникальная для этой породы. Иногда определенный фиксированный признак может быть общим у нескольких пород, например хондродисплазия (короткие ноги) или брахицефалия (короткий нос).В случае общей мутации можно искать общие области гомозиготности среди таких пород. В этих случаях можно также выполнить картирование ассоциаций между породами, как описано выше.
1.5 Секвенирование следующего поколения В 1970-х годах стало возможным клонировать и секвенировать дезоксирибонуклеиновую кислоту (ДНК) и тем самым связать генетическую связь с лежащей в основе последовательностью ДНК (Altshuler et al., 2008). Примерно три десятилетия основным выбором для секвенирования ДНК были методы, требующие электрофоретического разделения фрагментов ДНК.Именно разработка методов высокого разрешения, которые могли разделять фрагменты ДНК, различающиеся по размеру, всего на одно основание, в первую очередь сделала возможным секвенирование. Обзоры см. В (Shendure & Ji, 2008; Shendure et al., 2004). Автоматизация, распараллеливание и усовершенствование секвенирования по Сэнгеру были путем к повышению экономической эффективности (Shendure et al., 2004). Задача секвенирования всего генома человека была поставлена еще в 1985 году и мотивировала снижение затрат с 10 долларов США на готовую основу до 10 оснований на 1 доллар США (Shendure et al., 2004). В 2001 году были опубликованы два проекта последовательностей генома человека (Lander et al., 2001; Venter et al., 2001). Вслед за проектом генома человека были предприняты несколько академических и коммерческих усилий
19
с целью разработки новых сверхнизкозатратных технологий секвенирования (Shendure et al., 2004). За последние семь лет эти новые технологии быстро развивались, и теперь широко доступны платформы массового параллельного секвенирования ДНК. Эти технологии производят относительно короткие считывания по сравнению с секвенированием по Сэнгеру.Использование коротких чтений стало сильнее и ценнее с появлением полных геномных сборок для человека и других видов. Эти сборки предоставили эталонные последовательности генома различных видов, с которыми можно было сопоставить короткие чтения, тем самым предоставив информацию о генетической изменчивости (Shendure & Ji, 2008). Термин «секвенирование второго поколения» был предложен (Shendure & Ji, 2008) и использовался для реализации параллельного секвенирования циклического массива (например, как в коммерческих продуктах: 454 Genome Sequencer, Illumina Genome Analyzer и платформа SOLiD).Электрофоретическое разделение больше не требуется, но секвенирование выполняется путем синтеза в повторяющихся циклах ферментативных манипуляций и сбора данных базы изображений. Миллионы ПЦР-колоний фрагментов ДНК иммобилизуют на матрице и одновременно секвенируют параллельно. Сейчас появляются технологии «третьего поколения», которые обещают еще более высокую пропускную способность, большую длину считывания, меньшее количество исходных материалов, более высокую согласованную точность и даже более низкие затраты. Для обзора см. (Schadt et al., 2010). Секвенирование следующего поколения (NGS) может применяться по разным причинам, и оно может значительно ускорить биологические и биомедицинские исследования (Schadt et al., 2010; Shendure & Ji, 2008). Исследования картирования по всему геному у собак, у которых мутация является общей для нескольких пород, могут идентифицировать области-кандидаты менее 100 т.п.н., но области-кандидаты могут иметь длину до 2 МБ для мутаций, специфичных для одной породы, как обсуждалось выше (Karlsson & Lindblad -Тох, 2008).Повторное секвенирование всего региона в нескольких случаях и в контролях было бы слишком дорогостоящим до разработки технологий NGS, но теперь дает возможность идентифицировать причинную мутацию. В этой диссертации технология Illumina NGS использовалась для целевого обнаружения вариаций последовательностей в геномных регионах, связанных с конкретными признаками или заболеванием (документы II и IV). В статье III мы оценили задачу извлечения наиболее важной информации из очень большого количества данных, получаемых с помощью секвенирования следующего поколения.
20
2
Цели диссертации
Общая цель этой диссертации состояла в том, чтобы найти в геноме собаки генетические факторы риска, лежащие в основе генетических заболеваний собак, с использованием методов биоинформатики. Конкретные цели заключались в следующем: I. Проведение полногеномного исследования ассоциации на толлинг-ретривере уток породы Новошотландия для выявления локусов восприимчивости к иммуноопосредованному комплексу заболеваний, сходных с системной красной волчанкой (СКВ) человека. II. Составьте карту локуса характерного морщинистого фенотипа кожи породы шарпей и нанесите на карту специфическую для породы семейную лихорадку шарпея (FSF), заболевание, сходное с несколькими аутовоспалительными синдромами человека.III. Разработайте простой в использовании веб-инструмент для анализа данных из проектов NGS, чтобы облегчить выявление причинных мутаций в целевых проектах повторного секвенирования «случай-контроль». IV. Определите локусы, предрасполагающие к повышенному риску глиом (первичных опухолей головного мозга) у брахицефальных (коротконосых) пород собак, и поместите их в контекст путей глиомагенеза, имеющих отношение к заболеваниям человека.
21
3
Ассоциативное картирование по всему геному позволяет идентифицировать несколько локусов заболевания, связанного с СКВ, у толлинговых ретриверов уток Новой Шотландии (Документ I)
3.1 Общие сведения Заболеваемость аутоиммунными заболеваниями чрезмерно высока среди толлинговых ретриверов из Новой Шотландии (NSDTR). В частности, два типа иммуноопосредованных фенотипов чаще диагностируются у NSDTR по сравнению с другими породами. Это иммуноопосредованная ревматическая болезнь (IMRD) и стероид-зависимый менингит-артериит (SRMA) (Hansson-Hamlin & Lilliehook, 2009; Anfinsen et al., 2008; Redman, 2002). Первичный вопрос в этом проекте состоял в том, чтобы определить, представляют ли они два отдельных заболевания или они имеют общие генетические факторы риска.Комплекс болезни IMRD имеет много общих клинических признаков с системной красной волчанкой (СКВ) человека. У собак с IMRD часто обнаруживаются антинуклеарные аутоантитела (ANA) (70%) и артрит (100%). Другие симптомы, которые иногда наблюдаются как у собак, так и у людей, включают лихорадку и поражение кожи, печени и почек (Hansson-Hamlin & Lilliehook, 2009; Koskenmies et al., 2008; Tan et al., 1982). Собаки с диагнозом SRMA обычно имеют типичное острое течение болезни с сильной болью в шее, ригидностью и лихорадкой.В большинстве случаев лечение кортикостероидами дает хороший результат (Anfinsen et al., 2008). Большинство аутоиммунных заболеваний у людей являются результатом сложного наследования с участием нескольких генов, стохастических факторов и факторов окружающей среды (Mariani, 2004). Точно так же анализ родословных показал, что связанные с СКВ заболевания, наблюдаемые в NSDTRs, связаны с полигенным наследованием. Порода NSDTR
23
пережила серьезное узкое место, когда очень небольшая популяция пережила две разрушительные вспышки вируса чумы собак в 1908 и 1912 годах (Strang & MacMillan, 1996).В этой статье мы выполнили общегеномное исследование ассоциации (GWAS) в NSDTR, чтобы определить местонахождение кандидатных локусов для этого иммуно-опосредованного комплекса заболеваний. Моделирование показало, что для сложного признака аллели риска, которые увеличивают риск в 5 раз, могут быть обнаружены (в 97% случаев) с использованием только ≈ 15000 SNP и ≈100 случаев и ≈100 контрольных значений (Lindblad-Toh et al., 2005). Учитывая недавний дефицит популяции и высокую распространенность болезней у этой породы, мы ожидали обнаружить несколько сильных факторов риска.
3.2 Методы и результаты Для выполнения картирования ассоциации по всему геному мы использовали массив SNP собак Illumina с 22 000 маркерами. Мы использовали 81 случай (37 с диагнозом IMRD, из которых 22 были ANA-положительными и 44 с диагнозом SRMA) и 57 контрольных точек, чтобы идентифицировать пять локусов-кандидатов, расположенных на CFA 3, 8, 11, 24 и 32. Анализы были выполнены для всех случаев вместе и для ANA-положительных случаев IMRD и SRMA отдельно (Рисунок 3).
24
25
Рис. 3. (a) Все случаи, проанализированные вместе, показали один сильно связанный пик на CFA 32.(b) Ассоциированные области были расположены на четырех хромосомах у ANA-положительных собак (CFA 3, 8, 11 и 24). c) Один регион на CFA 32 был значительно связан с SRMA. (Рисунок изменен из статьи I). Программный инструмент PLINK (Purcell et al., 2007) использовался для выполнения всех статистических тестов, включая расчеты ассоциаций, а также для корректировки стратификации населения и множественного тестирования. Собаки, использованные в анализе, были из Финляндии и Швеции, и графики многомерного масштабирования показали наличие некоторой стратификации популяции.Поэтому для разделения выборок на две группы использовалась кластеризация идентичности по состояниям (IBS). Затем использовали статистику ассоциации Кохрана-Мантеля-Хэнзеля (CMH) для проверки ассоциации SNP-заболевание, обусловленной кластеризацией. Этот метод использовался, чтобы избежать ложноположительных результатов из-за субпопуляций с разными частотами аллелей, а также для увеличения способности обнаруживать истинно положительные результаты. Начальные значения p находились в диапазоне 10-5-10-6. На втором этапе мы использовали перестановочное тестирование (т. Е. Смена меток фенотипов) при условии кластеризации на две группы, таким образом контролируя стратификацию и корректируя множественное тестирование.Скорректированные значения p (Pgenome), основанные на 100000 перестановок, достигли общегеномной значимости (отсечка 0,05) для трех локусов, расположенных на хромосоме 8 (Pgenome ≈ 0,02) и хромосоме 24 (Pgenome ≈ 0,04) для ANA-положительных собак и на 32-й хромосоме (Pgenome ≈0,04) у собак с диагнозом SRMA (рис. 3). Все пять локусов были включены в продолжающееся точное картирование. Согласно рекомендованному уровню техники, за картированием всего генома в пределах одной породы должно следовать точное картирование у нескольких пород, чтобы идентифицировать
26
более коротких общих гаплотипов между породами (Karlsson & Lindblad-Toh, 2008).К сожалению, поскольку эти СКВ-подобные заболевания редко встречаются у других пород, у нас не было достаточного количества выборок, чтобы можно было сузить области, используя этот метод. Тем не менее, точное отображение также имеет цель проверить связанные регионы путем добавления дополнительных наблюдений и элементов управления. SNP были отобраны с плотностью ≈ 1 SNP / 10 kb в ассоциированных регионах. Дополнительные NSDTR были включены в общей сложности 324 собаки (82 с IMRD, из которых 32 показали ANA-положительные, 78 с SRMA и 173 контрольные; девять собак были классифицированы как имеющие IMRD и SRMA).Три локуса (CFA 3, 11, 24), ассоциированные с ANA-положительностью, были строго подтверждены со значениями p в диапазоне 10-11-10-13. Два других локуса (CFA 8 и 32) были проверены, но с более слабыми значениями p 10-5 и 10-8 на этапе точного картирования. На этапе точного картирования было обнаружено, что область 1,6 Мб на CFA 32 является наиболее связанной с SRMA, но также связана с ANA-положительностью и, следовательно, со всеми случаями вместе.
3.3 Обсуждение и перспективы на будущее В заключение, пять локусов были идентифицированы как ассоциированные с комплексом заболеваний, связанных с СКВ, в NSDTRs с использованием стратегии двухэтапного картирования.Связанные области содержат несколько генов, что затрудняет определение причинных, хотя некоторые из генов являются отличными кандидатами на основе их биологической функции. Поразительно, но четыре гена-кандидата (PPP3CA, HOMER2, DAPP1 и PTPN3) из трех связанных областей все участвуют в регуляции пути ядерного фактора активированных Т-клеток (NF-AT). Хорошо известно, что факторы транскрипции NF-AT участвуют в активации Т-клеток, а также в формировании периферической толерантности к аутоантигенам (Serfling et al., 2006). Активация кальциневрина (кодируемого PPP3CA), хорошо известной мишени для иммунодепрессантов, приводит к активации пути NF-AT (Clipstone & Crabtree, 1992). Сообщалось, что кальциневрин и NF-AT по-разному экспрессируются у людей с СКВ по сравнению со здоровыми людьми (Kyttaris et al., 2007; Guerini, 1997). Для получения дополнительных сведений о генах-кандидатах в связанных регионах см. Статью I. Как и ожидалось, похоже, что у этой породы собак присутствует несколько локусов, каждый из которых оказывает сильное влияние на развитие этого иммунно-опосредованного комплекса заболеваний, и что сочетание этих генетических факторов риска может быть достаточным, чтобы предрасположить к заболеванию.Поскольку сильные факторы риска, которые редко встречаются у людей, ускользают от GWAS, мы предполагаем, что исследования на собаках могут быть ценным дополнением к идентификации генов и путей, которые участвуют в развитии сложных заболеваний и, таким образом, приносят пользу обоим видам. Гибридный захват с последующим секвенированием следующего поколения был запланирован в качестве следующего шага, чтобы исследовать связанные области более подробно и иметь возможность идентифицировать причинные варианты.
27
4
Картирование гомозиготности идентифицирует выбранный локус для характерного фенотипа кожи у шарпейских собак (Документ II)
4.1 Предыстория Собака породы шарпей имеет характерный для породы фенотип морщинистой кожи, который был тщательно отобран. Кожа утолщенная и складчатая, морда сильно набита. Существует предковый тип шар-пея с менее выраженным состоянием кожи, который называется шар-пей «традиционного» типа, в то время как тип, выбранный по фенотипу кожи, называется типом «мясорубка». Известно, что основным компонентом утолщенной кожи шар-пейских собак является гиалуроновая кислота (HA), и что у шарпей-мясорубок уровень HA в сыворотке крови в два-пять раз выше (Zanna et al., 2008). Подобное состояние было описано у людей (Ramsden et al., 2000) и названо гиалуронанозом. Помимо кожного заболевания, среди мясорубок очень часто встречается аутовоспалительное заболевание, называемое семейной лихорадкой шар-пея (FSF). По оценкам, в 1992 г. 23% особей этой породы в США были поражены (Rivas et al., 1992). Заболевание клинически напоминает некоторые наследственные синдромы периодической лихорадки, наблюдаемые у людей, такие как семейная средиземноморская лихорадка (FMF). Состояние как у человека, так и у собаки характеризуется рецидивирующей лихорадкой неизвестного происхождения и местным воспалением, обычно поражающим основные суставы.В качестве осложнения рецидивирующего или хронического воспаления пациенты-люди, а также собаки шарпеев подвержены риску развития реактивного системного амилоидоза АА и последующей почечной или печеночной недостаточности (Stojanov & Kastner, 2005; Rivas et al., 1992). (AA-амилоидоз – это форма амилоидоза, связанная с сывороточным амилоидным белком A (SAA) (Lachmann et al., 2007).) GWAS с использованием 18 случаев и 18 контролей, но без получения каких-либо значимых результатов.(Данные не показаны в документе.) Породы собак предлагают возможности генетически изолированных популяций для ассоциативного картирования, но в случаях, когда гомозиготность обширна, большие области генома не будут обнаружены при ассоциативном картировании. Следовательно, мы предположили, что отбор по фенотипу кожи мог скрыть область, ответственную за лихорадку, и что обнаружение локуса фенотипа кожи может также привести нас к мутации, вызывающей синдром лихорадки. Также было возможно, что исследование было недостаточно мощным, и параллельно было собрано больше образцов.
4.2 Методы и результаты Мы проверили геном шар-пея на предмет признаков избирательного захвата путем поиска длинных участков гомозиготности или снижения гетерозиготности. Мы исследовали геном шар-пея отдельно, выполнив поиск общей гомозиготности у 50 собак шар-пея, а также сравнили его с 230 контрольными собаками из 24 других пород. Мы использовали подход скользящего окна, чтобы исследовать соотношение гетерозиготности по сравнению с другими породами в каждом окне из 10 последовательных SNP, используя 50.000 SNP, равномерно распределенных по геному (массив Affymetrix 50K собак). Самый сильный сигнал о сниженной гетерозиготности был локализован в области ≈3,7 мб на CFA 13 (CanFam 2.0 chr13: 23,4879,92-27,227,623). Отношение гетерозиготности у шар-пейских собак было в 10 раз ниже по сравнению со средним соотношением, обнаруженным у собак контрольных пород (рис. 4 A), и почти полная гомозиготность наблюдалась у шар-пеев рядом с HA-синтазой 2 (HAS2). ген (рис. 4 C). HA синтезируется тремя различными HA-синтазами (HAS1, HAS2, HAS3), причем HAS2 является ферментом, ограничивающим скорость (Weigel et al., 1997). Учитывая сильный сигнал отбора и знание того, что состояние кожи связано с избыточными отложениями HA, эта область стала очевидным кандидатом на мутацию, вызывающую морщинистую кожу. Параллельно с этим было собрано больше собак для проведения GWAS синдрома лихорадки, и, что важно, классификация фенотипов была более строго определена, чем раньше. Всего было сравнено 22 случая и 17 контролей, и теперь они достигли общегеномной значимости (лучший SNP Praw = 2,3 x 10-6, Pgenome ≈0.01 на основе 100000 перестановок) (рис. 4 B). В анализе использовался набор из 17 227 SNP, общих для массивов 27 КБ и 50 КБ, поскольку не все люди работали на одном и том же типе массива. Программный пакет PLINK (Purcell et al., 2007) использовался для анализа ассоциации. Как видно на рис. 4C, наиболее ассоциированные SNP (синяя линия) были расположены на CFA 13 рядом с выбранной областью. Поскольку ассоциация не может быть обнаружена там, где нет вариации, и, следовательно, уменьшается там, где растет гомозиготность (красная линия), трудно определить наиболее вероятное место для причинной мутации.
30
a
Chr13 10 Chr6
Снижение гетерозиготности
Chr5 8 6
ChrX
4 2
0 1
2
89
11
13
15
17
19
21
23
25 27 29 31 33 35 37
X
Хромосома #
b 6 Пгеном = 0.01
5-
–log10 (P)
43210
1
2
3
4
5
6 7
8
9
170002 11
11
19
21
23
25
27 29 31 33 35 37
X
80 70
1 0
60
0,5
гомозиготность%
1,3 9000 Log%
1,3 9000 [Пгеном (100000 перестановок)]
13
Хромосома №
22
23
24
25
26
27
28
29
30 9000
34
Положение на Chr 13 (МБ) HAS2
ZHX2
Рисунок 4.Признаки избирательного охвата и ассоциации с FSF a) Наибольшее снижение гетерозиготности шар-пеев (n = 50) по сравнению с 24 другими породами (n = 230) наблюдалось на хромосоме 13. Относительная гетерозиготность была рассчитана при скольжении по 50 000 генома. -широкие SNP с размером окна 10 последовательных SNP. (b) Исследование «случай-контроль» для семейной лихорадки шарпея (FSF) показало самую сильную связь с CFA 13 (лучший SNP Praw = 2,13 x 10-6, Pgenome ≈0,01 на основе 100000 перестановок). (c) Ассоциация с FSF совмещена с сигналами отбора на CFA 13.SNP, связанные с FSF (синяя линия), перемежались сигналами выбора (красная линия). (Рисунок изменен из статьи II). Для поиска мутации, вызывающей фенотип морщинистой кожи (гиалуронаноз), мы нацелены на область-кандидат, используя специально разработанный массив захвата последовательностей от Roche NimbleGen. Захват цели сопровождался повторным секвенированием большой области 1,5 Мб (CanFam 2.0 chr13: 22 937 592 24 414 650). Эта область считалась наиболее вероятной для отбора и включала ген-кандидат HAS2.Область 31
также включала некодирующую РНК, антисмысловую HAS2, которая, как предполагалось, действует как негативный регулятор HAS2 (Chao & Spicer, 2005). Были повторно секвенированы семь собак: два шар-пея с мясом рта с высоким уровнем сывороточной НА, два шар-пея традиционного типа и три собаки из других контрольных пород. Полученные считывания последовательности были сопоставлены с эталонной последовательностью генома Боксера, и у каждой собаки было идентифицировано ≈1500 SNP и ≈670 инделей. Девять вариантов (восемь SNP и один indel) были уникальны для двух секвенированных шарпей с мясом рта и располагались внутри консервативных элементов.Дополнительное генотипирование этих вариантов у нескольких шар-пеев и собак других пород показало, что они не были специфичными для шар-пеев и впоследствии были исключены как причинные для фенотипа. Сравнение охвата в целевом регионе выявило две перекрывающиеся дупликации у шарпейских собак. Анализ количества копий был проведен на нескольких собаках для двух дупликаций и подтвердил, что дупликации были уникальными для шарпейцев. Более крупная дупликация размером 16,1 т.п.н. была уникальна для болотного шар-пея (CanFam 2.0 Chr13: 23,746,089–23,762,189), в то время как меньшая дупликация размером 14,3 т.п.н., по-видимому, имеет свое происхождение от традиционного шар-пея (CanFam 2.0 Chr13: 23,743,906–23,758,214). Далее было обнаружено, что существует значительная корреляция между количеством копий мясного рта и семейной лихорадкой шарпея (FSF) (p =
Mark von Nagy vonnagy.com / | Марк фон Надь – новичок
Фотограф из Зеландии, специализирующийся на пейзажной фотографии на
Северный остров. | |
Роберт Нэйш Канада robnaish-art.ca/ | Мои работы городские
воздействовали с помощью краскопульта и найденные предметы, использованные в качестве трафаретов), чтобы
выражать свои видения и психические реакции на современную городскую культуру
и окружающая среда. | |
M Najaka watercolorart.com | Мои акварели воспроизводится как жикле ограниченным тиражом. Более подробную информацию можно найти о меня на моем веб-сайте и в моем блоге. | |
Натаха натхача.com / | Школа графики
– Gutenberg College – ИЛЬКИРШ-Граффенштаден – Франция. Подготовка с
конкурс декоративно-прикладного искусства Страсбурга – цитата: сентябрь
2004 г. Первые цены на масляную краску 2004 г. – Thionville 3-я цена краска на масляной основе 2004- Лосхайм-ам-Зее – Германия 2005 – СЕРЕБРЯНАЯ МЕДАЛЬ – Всемирный Центр мира – ВЕРДУН Организовано ART – INTERS | |
Тони Нацулас tonynatsoulas.com / | Образование: Магистр. Изобразительное искусство, Калифорнийский университет в Школе живописи Дэвиса Скоухегана и скульптура, Скоухеган, Институт Мэриленда, Колледж искусств, Балтимор, Мэриленд, бакалавр искусств, Калифорнийский университет в Дэвисе Калифорнийский государственный университет в Сакраменто, | |
Norma Nava Норманава.com / | Я родился около львиного цветная река, в созвездии Девы, в городе Оливос, Висенте Округ Лопес, Буэнос-Айрес, Аргентина. | |
Mercedes Naveiro mercedesnaveiro.com.ar/ | Родился в Аргентине. нас
Гражданин Бакалавр, Американский университет МИД, Вашингтон, округ Колумбия. Жил в США, Мексике,
в настоящее время проживает в Буэнос-Айресе, Аргентина.Подробнее см.
сайт | |
Эдита Назарайте portraitsbyedita.com/ | Эдита Назарайте
многоязычный художник, она прекрасный художник и поэт. Эдита родилась в
Литва. В 1984 году она приехала в Канаду. С 1991 года живет и работает в г.
Вирджиния, США.Художник имеет два диплома в области изобразительного искусства, в общей сложности девять лет.
из художественных образований в Европе и США. | |
Пол Нидс mucusart.co.uk/ | Пол Нидс – художник, писатель и исполнитель, чье время смутно разделено между созданием и экспонируя свою успешную серию «мегалитических размышлений» (масляные изображения британских доисторических памятников), современное видение внутренней части города и редактирование поэтического журнала «Уродливое дерево».он хотел бы выйти более. | |
Джозеф Нечватал nechvatal.net/ | С 1986 года Джозеф Нечватал работал с компьютерно-роботизированной ассистирующей живописью. Его компьютер-робот картины и анимации компьютерного программного обеспечения регулярно демонстрируются в галереи и музеи по всему миру. | |
Пол Нивел paulneevel.com / | Изобразительное искусство и фриланс
фотография в Юджине, штат Орегон. | |
Дональд Нефф donaldneff.com/ | «Я рисую те места, которые люблю быть. Я рисую свежесть вечной природы, ледяные прозрачные ручьи, грозовые водопады и высокие гранитные гребни над безмолвными озерами.я нарисовать описания Джона Мюра, отголоски Анселя Адамса, Американский запад Альберта Бирштадта и Томаса Морана. Я рисую светимость фильтруя ландшафт, достигая основания ручья, отскакивает от камней и освещает тени ». | |
Линда Нельсон линда-нельсон.co.uk/ | Я внештатный сотрудник иллюстратор и дизайнер с северо-востока Англии. Моя работа смелый, стилизованный, красочный и милый, специализирующийся на детских рассказах иллюстрации, которые были опубликованы. Я также создал иллюстрации для обложек DVD, брошюр и сайтов. Я работаю в цифровом формате или маслом, акрилом и акварелью. Пожалуйста, свяжитесь со мной для получения дополнительной информации информации или для образца пакета. | |
Марк Нельсон gringolandiastudio.com/ | Генеральный директор Художник Марк Нельсон бежит его студия Пльзень-Чикаго с этого онлайн-сайта. Нельсон, междисциплинарный художник использует пародию и остроумие для решения субъективных привилегия в американской культуре | |
Норман Немет Канада arustudios.com / | Все картины, которые я
create вдохновлен Африкой. На моем сайте вы найдете КУЛЬТУРНЫЙ, ЭТНОГРАФИЯ И ДИКАЯ АФРИКА | |
Юлияна Немети Швеция unitedart.se/ | Jobbar с nordisk mytologi мед олика текникер | |
Дима Ненчева Канада Веб-сайт: ненчев.com / gallery | У Димы Ненчева уникальный талант сделать четыре разных картинки в одном кадре. Она развила ее собственный стиль: МНОГОПОЗИЦИОННЫЙ КОНЦЕПТИВНЫЙ РЕФЕРАТ. Вращающийся кадр показывает разные предметы на каждой позиции! Она является членом: Ассоциации профессиональных художников изобразительного искусства, Lakeshore Arts и Club One of aind. | |
Тереза Нептун тересанептун.com / | Я впервые взял в руки
камера, будучи подростком, живущим в Париже. Я любил черно-белое
фотография с тех пор. В настоящее время я проживаю в резидентуре художника на
Каньон-роуд в Санта-Фе, Нью-Мексико. Моя страсть – запечатлеть моменты, которые
существуют одно мгновение, а затем ушли навсегда. Я фотографирую США Юго-Запад и Европа. Наслаждайтесь! | |
Жан Несс scarletbbwart.com / | Празднование десятилетия в качестве графического дизайнера / иллюстратора Жан Несс [JNESS] начал свою карьеру художник-график в 1994 году в отделе маркетинга Daily Racing Form создание инновационных рекламных кампаний. За это время он принял различные курсы дизайна в Школе визуальных искусств. Позже Жан продолжил агрессивный график работы фрилансера на 4 года с Update Graphics, один ведущих поставщиков медиаискусства в Нью-Йорке. | |
Инго Нойбергер ineuberger.de/ | I. Neuberger wurde 1926 г. в
Halle an der Saale geboren. Studien absolvierte er bei den Kunstmalern
Фишер-Ламберг и Шмидт-Штиль в Галле. Seit 1961 гештальтет I.
Neuberger als freischaffender Künstler seine Werke. Seine Vorliebe позолота
den romantischen Landschaften und W äldern. Zahlreiche Studienreisen führten Ihn ins In- und Ausland. | |
Ян Ньюбери Швеция ian.shows.it | Скульптор | |
Чарльз Ньюленд США cenewland.com/ | Дата рождения: 3 декабря 1934 г. в г. Маршалл, штат Мичиган, США.Художественные школы: Художественная школа Форт-Уэйна, Форт. Уэйн IN – Washington School of Art (заочное обучение) Актуальное образование: Работа с ведущими профессиональными коммерческими художниками научила меня всему, что я знать. | |
Болдуин Ньютон США home.earthlink.net/~bnewton6 | бакалавр изящных искусств,
Университет Меерут, Меррут, Индия Диплом в области изящных искусств, Лакхнау, UP Индия картин Ньютона выставлялись в Индии, Европе, Канаде, и по всей территории Соединенных Штатов на пригласительных выставках.Болдуин Ньютон отмечен многочисленными публикациями. “Искусство мистера Ньютона глубокая, таинственная. Они втягивают вас и нелегко отпускают чтобы изучить следующий холст. Сочные цвета неописуемы ». Cincinnati Enquirer 7 февраля 2000 г. | |
Таму Нгина maznayim.com/ | Чикаго родился самоучкой Художник Таму Нгина – профессиональный художник с 1998 года.Ее искусство в частные и корпоративные коллекции в США, Австралии, Новой Зеландии. Зеландия, Австрия, Канада, Германия, Дания, Сингапур, Южная Африка и Израиль. Вдохновленный Климтом, Пусетт-Дарт, Кандински, Клее, О’Киф и Кало. Стремятся экспериментировать с плавными геометрическими формами и яркими цветами. Грандиозное путешествие моей души – рисовать, чувствовать цвет и выражать | |
Хунг Вьет Нгуен да.com / nguyen-viet-Hung | Хунг Вьет Нгуен (род.
VietNam-1957, работает в США) – художник-самоучка, его картины имеют
были отобраны на многих художественных выставках жюри, собраны в Канаде, Франции,
Великобритания, США и Вьетнам. | |
| Храм Лесли Нгуен Гавайи США | Историческое тибетское искусство проекты, охрана животных, морской пейзаж, портреты и природа, шелк с минеральные пигменты | |
Храм Террис Нгуен тибетколор.com / | Историческое тибетское искусство
проекты, охрана животных, морской пейзаж, портреты и природа, шелк с
минеральные пигменты | |
Лотар Никель lotharskulptur.com | Я живу и работаю одинаково в
Германия, Италия и США. Я предпочитаю мрамор, но я также работают с гранитом, медью, бронзой и сталью | |
Бенте Кристиан
Нильсен 123hjemmeside.dk / galleri-bcn | Я художник-самоучка и рисую вот уже шесть лет. В 2000 году у меня был мечтаю о картине. Я отчетливо увидел картину, а когда проснулся, я сделал свой первый снимок человека на дереве. Я когда-либо рисовал с … | |
Джон Гесагер Нильсен Норвегия гесагер.com / | Født i Silkeborg, Дания,
bosatt i Larvik, Norge, siden 1956. Billedhugger Medlem av norsk billedhuggerforening og NBK | |
Дерек Нильсен daementia.com/ | N Родился в Юте в 1968 году вырос. в Аризоне Нильсен получил классическое образование в области студийного искусства и иллюстрация, пройдя обучение в США и Франции.После работы в качестве иллюстратор и художник-портретист, он радикально погрузился в метафизический аннотация. В течение 14 лет экспериментов он пришел к стилю живописи, в котором нелинейная наука вызывают у зрителя нелокальную эндокринную реакцию. Из-за власти картин Нильсена, чтобы раскрыть слои скрытого сознания, которым он востребован шаманами и целителями, а также коллекционерами произведений искусства | |
Лейф Нильсен Дания арт.dk / | Billedkunstner Maleri, skulptur, grafik Galleri GAL Det lille galleri med store oplevelser | |
Рица Нильсен 123hjemmeside.dk/ritza | Я научился рисовать в 1999 году и я использовал все свои каникулы, чтобы получить дальнейшее образование. Я предпочитаю масло живопись и восковая роспись, и я преподаю восковую живопись.Сегодня я также делаю стеклянные украшения и другие изделия из стекла, что мне очень нравится много. Добро пожаловать на мой сайт. | |
Susanne Nielsen mormaler.webbyen.dk/ | Billedkunstner | |
Анита Нимейер anitaniemeyer.com | Я канадский художник
живу в Торонто. Мои картины маслом отражают мой интерес к природа во фруктах, овощах и цветах. Я работаю в реалистичном стиль и наслаждайтесь смелой и яркой палитрой. | |
Ана Нието ananieto.com/ | 1997-1998 Tracor, Искусство
Школа.Бильбао, испания. Визуальные искусства и коммуникации. 1999 Работает на Фотокниги Голиафа. Франкфурт, Германия. 2000-2003 Школа визуализации Искусство. Манхэттен, штат Нью-Йорк. Изобразительное искусство / Фотография. | |
Йохан Ньюборг Бельгия johan-nieuwborg.exto.be/ | Ну, быть художником – значит мое мнение не то, чем ты становишься в результате какого-либо исследования, ты просто рожден таким способ.Сейчас известно несколько форм художественного образования, но они востребованы. превышает предложение. Если вы посмотрите на историю, это действительно любопытный факт: один можно заметить, что большинство великих художников никогда не имели образования; иногда им даже отказывали, когда они подавали заявку. Количество время, которое я трачу на конкретное произведение искусства, не имеет значения … каждая работа – это дело жизни. | |
Bert Nijenhuis Нидерланды bertnijenhuis.nl / | Скульптор, бронза | |
Bosse Niklasson Швеция mazartdesign.tk | Мои фавориты – аэрография, Рисунки тушью и карандашом | |
Лира Николаева lirasfineart.com/ | Лира родилась в России. недалеко от Черного моря, где опытный художник частным образом обучал ее несколько лет.Перед тем как иммигрировать в США, она побывала в Рим и Вена, где она была вдохновлена рисованием многих великих мастера. Излюбленная среда – масло в стиле классического реализма. Лира использует в своих работах богатые, контрастные цвета, эмоционально и драма. | |
Fran Nile artelvis.co.uk/ | Фрэн Нил – самоучка скульптор и огромный поклонник Элвиса Пресли.Этот сайт посвящен бронзовая скульптура Элвиса, созданная Фрэн | |
Марита Нильссон Швеция marni.se/ | Billedkunstner | |
Урбан Нильссон nilsson-art.com | Billedkunstner | |
Улла Брикс Ниссен Дания akvarelnissen.dk / | “АКВАРЕЛЬНИССЕН” | |
Джон Нолан Ирландия nolanart.com/ | Джон известен своим
уникальное использование цвета и стилизованных мотивов. наслаждайтесь его жизнерадостными яркими изображениями
выделены жирным контуром. Его работы собраны по всему миру. | |
Кевин Нолан цвета и формы.com / | Кевин родился в Дублине.
Ирландия в 1981 году в артистической семье. К тому времени, когда он перешел в среднюю В школе его интересы стали сосредоточены на живописи и философии. потом добившись там умеренных успехов, он решил поступить в колледж, где он изучал бы философию. | |
Ева Норберг Швеция Сайт: evanorberg.com | Att skapa är ett sätt att leva ut känslor, frågeställningar, drömmar och farhågor, förutsäga framtiden. Мота нйа утманингар – атт вåга вара восстание. Ge sig i kast med det man vill kunna bättre. Jag har ingen konstnärlig utbildning – betrakta mig som självlärd. Som liten var det färger som gällde. Och genom mina föräldrar träffade jag också väldigt många udda konstnärer och musiker. De levde för sin konst och avslutade sena nätter med långa tunga samtal om livet, själen och tillvaron. | |
Камилла Норберг Швеция konst.ams.se | Billedkunstner | |
Susanne Norberg Швеция susannenorberg.se/ | Billedkunstner | |
Ирен Норд Швеция irenenordh.nu / | Billedkunstner | |
Kerstin Nordh decode.se/kerstin | Billedkunstner | |
Berit Nordmark artnet.se/easy.pbs?url=62 | Billedkunstner | Изображение приближается |
Макс Магнус Норман Швеция Веб-сайт: maxmagnusnorman.ком | шведский международный
художник, рисует такие сказочные видения, которые можно увидеть перед сном или когда
ум находится в медитативном состоянии. Свенск интернэшнл констн är, м. ålar dr ömlika Visioner man kan se i meditativa tillst ånd. | |
Шэрон Норман sharonnorman.com/ | Работы Шарон Норман
фотожурналист, поскольку она переносит собственные фотографии на холст и
включает их в окрашенную поверхность. Ее работа о фотографическое путешествие, а также путешествие абстракции и движения окрашенная поверхность. | |
Люк Норманден lucnormandinillustration.com/ | Люк Норманден был работая иллюстратором более двадцати лет, его реалистичный стиль позволил ему работать в рекламных агентствах, журналах, редакциях, а также в музеологические цели.Помимо иллюстрации как таковой, он также понял, используя фотошоп, большие фрески, предназначенные также для выставок в Канаде как в США и Европе. | |
Конни Новотны эпзилон.darkgate.at | Пожалуйста, обратитесь к моему HP | |
Eria “Sane” Nsubuga Уганда африканских цвета.net / nsubuga | имя исполнителя «Sane» в центральная Уганда, в настоящее время заканчивает степень магистра изящных искусств в Скульптура в школе промышленных и изящных искусств Маргарет Троуэлл, Макерере Университет, Кампала, Уганда – октябрь 2001 г. Окончил с дипломом первого класса. Степень бакалавра промышленных и изящных искусств, Университет Макерере. Он был лучшим студентом -1996-98 Изучал A ‘Level в Королевском колледже Будо, в Мпиги, Уганда, 1992–1995 гг., Закончил Королевский колледж Будо, 1991–1995 гг. Закончил начальное образование в начальной школе озера Виктория, Энтеббе | |
Нанн Няндер нанненяндер.se / | Портрет Нанн Няндер
Художник. Она пишет маслом. Ее техника основана на традиционные итальянские и фламандские стили живописи. Nanne изучила в Академии Флоренции во Флоренции Италия, а также несколько лет в мастерская норвежского художника-фигуратора Одда Нердрума. места, выставленные в Национальной портретной галерее в Лондоне Англия. | |
Джеймс Най Канада Джеймсные.com / | 28 лет. я был
покраска уже 6 лет. Не думаю, что когда-нибудь остановлюсь. | |
Дениз Нис Веб-сайт rsqstudio.com/ | Я визуальный художник В настоящее время я учусь на последнем курсе “Диплома по визуальному искусству”. Я недавно закончил мой сертификат по обучению и оценке на рабочем месте.На стороне моего дом У меня есть Художественная студия, которую я веду как малый бизнес, преподаю учащиеся в возрасте от 7 до 18 лет по специальности «традиционное искусство». Я также учу им захватывающие новые современные способы видения вещей. | |
Угочукву-Гладкий Нзеви Нигерия ugochukwu. |